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污水中新型冠狀病毒富集新選擇

2023-03-16 13:59瀏覽量:770

近期,美正生物推出智能水體微生物采集系統(tǒng),并與行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)WS/T799-2022《污水中新型冠狀病毒富集濃縮和核酸檢測(cè)方法標(biāo)準(zhǔn)》進(jìn)行了實(shí)驗(yàn)過(guò)程和實(shí)驗(yàn)結(jié)果的比較。聚乙二醇沉淀法、鋁鹽混凝沉淀法富集濃縮實(shí)驗(yàn),按照標(biāo)準(zhǔn)WS/T799-2022中試劑材料、操作步驟執(zhí)行。美正生物智能水體微生物采集系統(tǒng)(以下簡(jiǎn)稱(chēng)“美正超濾法”)按照說(shuō)明書(shū)執(zhí)行。


材料與方法


材料:

智能水體微生物采集儀、高速冷凍離心機(jī)、生物安全柜、超濾濃縮管(0.01μm)、過(guò)濾袋、移液器及吸頭、超濾濃縮管洗液、MS2過(guò)程控制試劑盒(RT-PCR探針?lè)?#xff0d;50°C)。


方法:

預(yù)處理:取不同渾濁程度的污水樣本,添加MS2混勻。樣本進(jìn)行4℃、5000g、30min或倒入過(guò)濾袋進(jìn)行預(yù)處理,兩方法均保留上清液,待用。


濃縮富集:

聚乙二醇沉淀法和鋁鹽混凝沉淀法按照標(biāo)準(zhǔn)WS/T799-2022進(jìn)行富集濃縮,得到水樣濃縮液,于0-4℃條件下保存,并于24h內(nèi)進(jìn)行核酸提取和熒光定量檢測(cè)。


美正超濾法使用智能水體微生物采集系統(tǒng)用超濾濃縮管進(jìn)行富集,富集后使用4mL超濾濃縮管洗液進(jìn)行洗脫,得到水樣濃縮液,于0-4℃條件下保存,并于24h內(nèi)進(jìn)行核酸提取和熒光定量檢測(cè)。


實(shí)驗(yàn)過(guò)程


實(shí)驗(yàn)過(guò)程.png


聚乙二醇沉淀法的實(shí)驗(yàn)步驟為預(yù)離心-二次離心-富集濃縮,需要使用高速冷凍離心機(jī)等昂貴設(shè)備,且多次離心、操作繁瑣,樣本處理時(shí)間為3.5-4h。鋁鹽混凝沉淀法的實(shí)驗(yàn)步驟為預(yù)離心-富集濃縮,實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)備時(shí)需要配置多種試劑,需要絡(luò)合溶解,樣本處理時(shí)間為2h。


美正超濾法實(shí)驗(yàn)步驟為預(yù)處理-濃縮-洗脫。高速離心、預(yù)處理2種方法均可滿(mǎn)足前處理,且無(wú)需使用及配置大量試劑,樣本處理時(shí)間為3-5min/100mL。綜上,從操作便捷性及所需時(shí)間來(lái)看,美正超濾法顯著優(yōu)于聚乙二醇沉淀法、鋁鹽混凝沉淀法。


實(shí)驗(yàn)結(jié)果


2.png

?注:數(shù)據(jù)來(lái)源于實(shí)驗(yàn)室,實(shí)際情況可能因樣本或操作等情況導(dǎo)致不同。


聚乙二醇沉淀法取3份35mL污水樣本,低渾濁回收率為5%±4%。鋁鹽混凝沉淀法取100mL樣本污水樣本,低渾濁回收率為16%±8%。美正方法取100mL樣本污水樣本,低渾濁回收率為70%±15%。


從表中可以看出,污水樣本越渾濁,回收率越低,其中聚乙二醇沉淀法高渾濁污水樣本回收率為ND。美正超濾法回收率顯著優(yōu)于聚乙二醇、鋁鹽混凝沉淀法。美正超濾法也可增大采樣體積,進(jìn)而提高檢出率。


討論


美正智能水體微生物采集系統(tǒng)可滿(mǎn)足污水中新型冠狀病毒富集濃縮。美正智能水體微生物采集儀可滿(mǎn)足大體積樣本的濃縮需求,隨樣本量體積的增加,可提高病毒陽(yáng)性率的檢出率。同時(shí)富集得到的病毒濃度大,更利于測(cè)序后續(xù)檢測(cè)。


不同病毒富集方法回收率樣本間差異大。可通過(guò)添加外源性?xún)?nèi)參,如噬菌體MS2、牛冠狀病毒疫苗、滅活鼠肝炎病毒等,來(lái)評(píng)估病毒富集回收率。


部分渾濁度較高的污水樣本提取后對(duì)反應(yīng)體系有抑制,可能干擾PCR反應(yīng)。建議同時(shí)對(duì)原液樣本、10-1稀釋樣本進(jìn)行檢測(cè),根據(jù)實(shí)驗(yàn)室試驗(yàn)結(jié)果,10倍稀釋樣本可有效減少抑制干擾。對(duì)于回收率的計(jì)算方法,建議參照GB4789.42諾如病毒檢驗(yàn)中外加擴(kuò)增控制,進(jìn)行計(jì)算。